Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF4AO95239 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms