Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG2O94898 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms