Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKL5O76039 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms