Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPM3O75607 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPM3O75607 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPM3O75607 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPM3O75607 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPM3O75607 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPM3O75607 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPM3O75607 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPM3O75607 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPM3O75607 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPM3O75607 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPM3O75607 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NPM3O75607 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPM3O75607 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPM3O75607 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPM3O75607 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPM3O75607 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPM3O75607 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPM3O75607 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPM3O75607 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPM3O75607 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPM3O75607 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NPM3O75607 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NPM3O75607 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NPM3O75607 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPM3O75607 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPM3O75607 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NPM3O75607 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPM3O75607 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPM3O75607 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPM3O75607 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPM3O75607 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPM3O75607 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPM3O75607 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPM3O75607 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPM3O75607 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPM3O75607 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NPM3O75607 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPM3O75607 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPM3O75607 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPM3O75607 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPM3O75607 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NPM3O75607 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPM3O75607 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPM3O75607 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPM3O75607 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPM3O75607 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPM3O75607 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPM3O75607 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPM3O75607 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPM3O75607 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPM3O75607 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPM3O75607 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPM3O75607 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPM3O75607 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPM3O75607 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPM3O75607 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPM3O75607 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPM3O75607 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPM3O75607 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPM3O75607 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPM3O75607 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPM3O75607 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPM3O75607 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPM3O75607 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPM3O75607 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPM3O75607 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPM3O75607 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPM3O75607 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NPM3O75607 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPM3O75607 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPM3O75607 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NPM3O75607 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPM3O75607 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPM3O75607 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPM3O75607 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPM3O75607 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPM3O75607 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NPM3O75607 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPM3O75607 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPM3O75607 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPM3O75607 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPM3O75607 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NPM3O75607 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPM3O75607 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPM3O75607 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPM3O75607 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPM3O75607 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NPM3O75607 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPM3O75607 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPM3O75607 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPM3O75607 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPM3O75607 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPM3O75607 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPM3O75607 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NPM3O75607 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPM3O75607 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPM3O75607 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPM3O75607 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPM3O75607 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms