Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN11O75508 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms