Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms