Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB11FIP3O75154 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11FIP3O75154 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms