Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NBNO60934 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBNO60934 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBNO60934 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBNO60934 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBNO60934 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBNO60934 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBNO60934 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBNO60934 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBNO60934 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NBNO60934 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBNO60934 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBNO60934 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBNO60934 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBNO60934 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBNO60934 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBNO60934 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBNO60934 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBNO60934 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBNO60934 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NBNO60934 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBNO60934 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NBNO60934 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBNO60934 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBNO60934 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBNO60934 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBNO60934 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBNO60934 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBNO60934 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBNO60934 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBNO60934 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBNO60934 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBNO60934 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBNO60934 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBNO60934 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBNO60934 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBNO60934 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBNO60934 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBNO60934 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBNO60934 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBNO60934 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NBNO60934 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBNO60934 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBNO60934 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBNO60934 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBNO60934 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NBNO60934 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NBNO60934 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NBNO60934 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBNO60934 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBNO60934 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBNO60934 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBNO60934 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBNO60934 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBNO60934 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NBNO60934 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBNO60934 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBNO60934 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBNO60934 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBNO60934 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBNO60934 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBNO60934 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBNO60934 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBNO60934 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBNO60934 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBNO60934 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBNO60934 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBNO60934 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NBNO60934 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBNO60934 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBNO60934 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBNO60934 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBNO60934 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NBNO60934 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBNO60934 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBNO60934 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBNO60934 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBNO60934 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBNO60934 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBNO60934 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBNO60934 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBNO60934 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBNO60934 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBNO60934 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBNO60934 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBNO60934 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBNO60934 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBNO60934 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBNO60934 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBNO60934 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NBNO60934 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBNO60934 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBNO60934 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBNO60934 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NBNO60934 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBNO60934 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBNO60934 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBNO60934 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBNO60934 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBNO60934 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms