Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PPLO60437 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PPLO60437 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PPLO60437 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PPLO60437 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
PPLO60437 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PPLO60437 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PPLO60437 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
PPLO60437 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PPLO60437 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PPLO60437 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PPLO60437 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PPLO60437 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PPLO60437 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PPLO60437 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PPLO60437 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PPLO60437 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PPLO60437 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PPLO60437 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PPLO60437 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PPLO60437 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PPLO60437 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PPLO60437 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PPLO60437 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PPLO60437 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PPLO60437 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PPLO60437 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PPLO60437 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PPLO60437 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PPLO60437 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PPLO60437 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PPLO60437 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PPLO60437 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
PPLO60437 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PPLO60437 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PPLO60437 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PPLO60437 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PPLO60437 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PPLO60437 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PPLO60437 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
PPLO60437 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PPLO60437 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PPLO60437 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
PPLO60437 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PPLO60437 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PPLO60437 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PPLO60437 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PPLO60437 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PPLO60437 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PPLO60437 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PPLO60437 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PPLO60437 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PPLO60437 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PPLO60437 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PPLO60437 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PPLO60437 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PPLO60437 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PPLO60437 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PPLO60437 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PPLO60437 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PPLO60437 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PPLO60437 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PPLO60437 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PPLO60437 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PPLO60437 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PPLO60437 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PPLO60437 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PPLO60437 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPLO60437 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPLO60437 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPLO60437 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPLO60437 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PPLO60437 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPLO60437 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPLO60437 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPLO60437 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPLO60437 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPLO60437 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPLO60437 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPLO60437 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPLO60437 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PPLO60437 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PPLO60437 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PPLO60437 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PPLO60437 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PPLO60437 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
PPLO60437 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PPLO60437 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PPLO60437 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPLO60437 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPLO60437 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PPLO60437 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPLO60437 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPLO60437 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPLO60437 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPLO60437 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPLO60437 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPLO60437 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPLO60437 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPLO60437 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms