Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA5O60264 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SMARCA5O60264 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms