Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3O43889 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3O43889 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3O43889 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3O43889 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3O43889 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3O43889 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3O43889 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3O43889 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3O43889 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3O43889 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3O43889 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3O43889 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3O43889 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3O43889 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3O43889 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3O43889 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3O43889 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3O43889 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3O43889 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3O43889 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3O43889 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3O43889 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3O43889 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3O43889 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3O43889 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3O43889 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3O43889 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3O43889 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3O43889 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3O43889 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3O43889 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3O43889 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3O43889 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3O43889 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3O43889 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3O43889 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3O43889 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3O43889 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3O43889 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3O43889 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3O43889 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3O43889 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3O43889 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3O43889 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3O43889 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3O43889 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3O43889 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3O43889 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3O43889 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3O43889 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3O43889 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3O43889 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3O43889 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3O43889 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3O43889 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3O43889 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3O43889 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3O43889 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3O43889 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3O43889 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3O43889 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3O43889 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3O43889 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3O43889 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3O43889 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3O43889 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3O43889 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3O43889 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3O43889 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3O43889 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3O43889 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3O43889 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3O43889 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3O43889 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3O43889 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3O43889 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3O43889 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3O43889 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3O43889 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3O43889 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3O43889 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3O43889 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms