Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms