Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms