Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF14O43557 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF14O43557 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF14O43557 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF14O43557 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF14O43557 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF14O43557 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF14O43557 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF14O43557 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF14O43557 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF14O43557 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF14O43557 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF14O43557 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF14O43557 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF14O43557 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF14O43557 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF14O43557 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF14O43557 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF14O43557 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF14O43557 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF14O43557 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF14O43557 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF14O43557 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF14O43557 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF14O43557 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms