Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEFVO15553 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEFVO15553 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MEFVO15553 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEFVO15553 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEFVO15553 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEFVO15553 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEFVO15553 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEFVO15553 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEFVO15553 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEFVO15553 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEFVO15553 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEFVO15553 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEFVO15553 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEFVO15553 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEFVO15553 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MEFVO15553 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEFVO15553 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MEFVO15553 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEFVO15553 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEFVO15553 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEFVO15553 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEFVO15553 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEFVO15553 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEFVO15553 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEFVO15553 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEFVO15553 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEFVO15553 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEFVO15553 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEFVO15553 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEFVO15553 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEFVO15553 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEFVO15553 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MEFVO15553 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEFVO15553 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEFVO15553 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEFVO15553 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEFVO15553 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEFVO15553 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEFVO15553 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEFVO15553 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEFVO15553 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEFVO15553 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEFVO15553 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEFVO15553 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEFVO15553 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEFVO15553 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEFVO15553 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEFVO15553 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEFVO15553 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MEFVO15553 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEFVO15553 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MEFVO15553 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEFVO15553 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEFVO15553 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEFVO15553 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEFVO15553 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEFVO15553 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MEFVO15553 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEFVO15553 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEFVO15553 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEFVO15553 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEFVO15553 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEFVO15553 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEFVO15553 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEFVO15553 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEFVO15553 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEFVO15553 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MEFVO15553 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MEFVO15553 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MEFVO15553 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEFVO15553 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEFVO15553 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEFVO15553 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEFVO15553 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEFVO15553 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEFVO15553 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEFVO15553 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEFVO15553 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEFVO15553 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEFVO15553 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEFVO15553 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEFVO15553 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MEFVO15553 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEFVO15553 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEFVO15553 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEFVO15553 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEFVO15553 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEFVO15553 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MEFVO15553 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MEFVO15553 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MEFVO15553 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MEFVO15553 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MEFVO15553 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MEFVO15553 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEFVO15553 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEFVO15553 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MEFVO15553 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEFVO15553 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEFVO15553 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms