Protein–RNA interactions for Protein: O15394

NCAM2, Neural cell adhesion molecule 2, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM2O15394 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAM2O15394 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms