Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHADO15335 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHADO15335 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHADO15335 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHADO15335 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHADO15335 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHADO15335 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHADO15335 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHADO15335 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHADO15335 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHADO15335 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHADO15335 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHADO15335 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHADO15335 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHADO15335 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHADO15335 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHADO15335 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHADO15335 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHADO15335 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHADO15335 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHADO15335 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHADO15335 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHADO15335 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHADO15335 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHADO15335 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHADO15335 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHADO15335 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHADO15335 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHADO15335 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHADO15335 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHADO15335 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHADO15335 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHADO15335 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHADO15335 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHADO15335 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHADO15335 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHADO15335 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHADO15335 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHADO15335 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHADO15335 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHADO15335 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHADO15335 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHADO15335 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHADO15335 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHADO15335 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHADO15335 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHADO15335 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHADO15335 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHADO15335 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHADO15335 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHADO15335 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHADO15335 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHADO15335 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHADO15335 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHADO15335 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHADO15335 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHADO15335 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHADO15335 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHADO15335 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHADO15335 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHADO15335 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHADO15335 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHADO15335 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHADO15335 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHADO15335 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHADO15335 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHADO15335 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHADO15335 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHADO15335 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHADO15335 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHADO15335 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHADO15335 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHADO15335 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHADO15335 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHADO15335 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHADO15335 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHADO15335 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHADO15335 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHADO15335 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHADO15335 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHADO15335 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHADO15335 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHADO15335 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHADO15335 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHADO15335 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHADO15335 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHADO15335 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHADO15335 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHADO15335 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHADO15335 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHADO15335 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHADO15335 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHADO15335 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHADO15335 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHADO15335 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHADO15335 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHADO15335 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHADO15335 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHADO15335 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHADO15335 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms