Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP290O15078 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP290O15078 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP290O15078 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP290O15078 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP290O15078 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP290O15078 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP290O15078 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP290O15078 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP290O15078 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP290O15078 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP290O15078 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP290O15078 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP290O15078 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP290O15078 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP290O15078 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP290O15078 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP290O15078 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP290O15078 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP290O15078 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP290O15078 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP290O15078 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP290O15078 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP290O15078 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP290O15078 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP290O15078 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP290O15078 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP290O15078 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP290O15078 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP290O15078 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP290O15078 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP290O15078 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CEP290O15078 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CEP290O15078 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CEP290O15078 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CEP290O15078 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP290O15078 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP290O15078 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP290O15078 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP290O15078 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP290O15078 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP290O15078 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP290O15078 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP290O15078 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP290O15078 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP290O15078 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP290O15078 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP290O15078 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP290O15078 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP290O15078 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP290O15078 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP290O15078 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP290O15078 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP290O15078 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP290O15078 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP290O15078 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP290O15078 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP290O15078 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP290O15078 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP290O15078 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP290O15078 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP290O15078 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP290O15078 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP290O15078 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP290O15078 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP290O15078 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP290O15078 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP290O15078 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP290O15078 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP290O15078 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP290O15078 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP290O15078 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP290O15078 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP290O15078 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP290O15078 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP290O15078 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP290O15078 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP290O15078 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP290O15078 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP290O15078 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP290O15078 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP290O15078 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP290O15078 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP290O15078 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP290O15078 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP290O15078 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP290O15078 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP290O15078 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP290O15078 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP290O15078 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP290O15078 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP290O15078 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP290O15078 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP290O15078 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP290O15078 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP290O15078 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP290O15078 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP290O15078 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP290O15078 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP290O15078 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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