Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
U2SURPO15042 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms