Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
BCKDKO14874 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCKDKO14874 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms