Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms