Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOCS6O14544 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOCS6O14544 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms