Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN5O00501 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms