Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF5O00463 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF5O00463 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF5O00463 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms