Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EIF3FO00303 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3FO00303 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms