Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms