Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC4-APOC2K7ER74 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms