Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC01387J3KSC0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC01387J3KSC0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms