Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRDCB7Z8K6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms