Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B4DEV8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
B4DEV8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B4DEV8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
B4DEV8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
B4DEV8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
B4DEV8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B4DEV8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B4DEV8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B4DEV8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B4DEV8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B4DEV8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B4DEV8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
B4DEV8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
B4DEV8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
B4DEV8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
B4DEV8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
B4DEV8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B4DEV8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
B4DEV8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
B4DEV8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
B4DEV8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B4DEV8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
B4DEV8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
B4DEV8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
B4DEV8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
B4DEV8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
B4DEV8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
B4DEV8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
B4DEV8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
B4DEV8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
B4DEV8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
B4DEV8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
B4DEV8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
B4DEV8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
B4DEV8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
B4DEV8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms