Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms