Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPDYE4A6NLX3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPDYE4A6NLX3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPDYE4A6NLX3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPDYE4A6NLX3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPDYE4A6NLX3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDYE4A6NLX3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDYE4A6NLX3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDYE4A6NLX3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDYE4A6NLX3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDYE4A6NLX3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDYE4A6NLX3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDYE4A6NLX3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDYE4A6NLX3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDYE4A6NLX3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms