Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf60A6NFR6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms