Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRBA1A5PL33 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRBA1A5PL33 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms