Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf170A2RU37 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms