Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIPSLA2A3N6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms