Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms