Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
E2F8A0AVK6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms