Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ST3GAL6-201ENST00000265261 3362 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ITIH1-211ENST00000537050 2493 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC092964.1-201ENST00000623304 1399 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SUPT5H-213ENST00000598725 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 RMI2-202ENST00000572173 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ADD1-206ENST00000398129 3787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AGA-201ENST00000264595 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PRKCA-AS1-203ENST00000584715 2113 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 FAM193A-202ENST00000382839 4710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 RORC-202ENST00000356728 3050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PAX9-201ENST00000361487 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PTGER3-206ENST00000370924 6982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ZNF460-201ENST00000360338 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TCERG1-202ENST00000394421 3633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ACSM5P1-201ENST00000566754 2438 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 CARMN-209ENST00000602315 2706 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ADAM21P1-202ENST00000530196 2049 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SLC35F4-201ENST00000339762 1779 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC016292.2-201ENST00000618967 210 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ATP1A3-201ENST00000302102 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AL590999.1-202ENST00000607215 3053 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 GRM8-203ENST00000358373 3850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 NBPF12-201ENST00000439206 1831 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 NBPF26-203ENST00000611702 1831 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 NBPF14-204ENST00000611826 1831 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 GAB4-201ENST00000400588 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CCDC144NL-AS1-207ENST00000577537 3727 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 OLFML2B-203ENST00000367940 2685 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 FAM196A-203ENST00000614311 4335 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 LINC01345-203ENST00000635247 1646 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 VPS11-207ENST00000620429 2739 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 IFIH1-201ENST00000263642 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 IPO4-201ENST00000354464 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CHRNB3-201ENST00000289957 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 HACL1-201ENST00000321169 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MAP3K7CL-216ENST00000545939 1407 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 RPE-202ENST00000359429 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC067852.6-201ENST00000591237 1736 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 KANSL1-211ENST00000575318 4935 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 NACA-201ENST00000356769 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SCN5A-209ENST00000451551 8343 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SCMH1-209ENST00000397174 2977 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SLC4A9-205ENST00000507527 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ACTR8-201ENST00000335754 3629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CACNA1D-228ENST00000638120 1830 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 C14orf93-201ENST00000299088 3354 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 COL19A1-205ENST00000620364 6233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TGM5-206ENST00000611276 2510 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ST3GAL3-217ENST00000372369 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.2 ms