Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TIRAP-202ENST00000392679 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC093525.7-201ENST00000569852 3626 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 TSPYL1-201ENST00000368608 3326 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AKAP10-201ENST00000225737 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 GCC2-201ENST00000309863 7537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 NDUFA5-211ENST00000611607 1504 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PTCD2-211ENST00000536805 1911 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 OSER1-AS1-202ENST00000437730 1563 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CAPN9-201ENST00000271971 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 MYT1-203ENST00000536311 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 NFASC-206ENST00000404076 5728 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC091959.3-201ENST00000506502 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 STXBP1-218ENST00000637173 4193 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 NR2F1-AS1-213ENST00000607797 3380 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LINC01503-201ENST00000423122 545 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 MIR3610-201ENST00000582903 73 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC007450.4-201ENST00000614709 524 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 IGF2BP2-203ENST00000421047 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC095350.1-201ENST00000443685 1711 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ANKRD34B-201ENST00000338682 3938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CA6-203ENST00000377443 1319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 UBIAD1-202ENST00000376810 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 COX6B2-209ENST00000590900 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 UHRF1-206ENST00000622802 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LIMCH1-208ENST00000508501 5054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LIMCH1-217ENST00000512946 5057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 C3orf35-201ENST00000328376 1859 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 MPP2-202ENST00000377184 4206 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CEP83-203ENST00000397809 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 JRKL-201ENST00000332349 2855 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AL596223.1-201ENST00000450995 1933 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SPOP-205ENST00000503676 1932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC007608.4-201ENST00000623140 3365 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 VWC2-201ENST00000340652 11299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ANKRD20A3-201ENST00000611388 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PRRX1-207ENST00000497230 3501 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AP001469.3-202ENST00000430259 2014 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CEP70-208ENST00000474781 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ZFAT-201ENST00000377838 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CLDN4-203ENST00000435050 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 GIMAP4-202ENST00000461940 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 MYT1-205ENST00000622439 2140 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AL138762.1-201ENST00000608554 1637 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 2191 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ARNT2-201ENST00000303329 6558 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ARMC8-221ENST00000491704 2777 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC068234.1-201ENST00000560629 2785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SCN5A-207ENST00000449557 5898 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PTK2B-203ENST00000397501 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ST5-207ENST00000526099 2404 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SNORA52-201ENST00000362915 134 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 TCEAL9-201ENST00000372656 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 TCEAL9-202ENST00000372661 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC098934.2-202ENST00000438944 1033 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC023162.1-201ENST00000505608 474 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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