Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
LINC01558Q9Y6Z2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC01558Q9Y6Z2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms