Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMTA1Q9Y6Y1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms