Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms