Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3AQ9Y6K1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3AQ9Y6K1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNMT3AQ9Y6K1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNMT3AQ9Y6K1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNMT3AQ9Y6K1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNMT3AQ9Y6K1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNMT3AQ9Y6K1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNMT3AQ9Y6K1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms