Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00312Q9Y6C7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms