Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD54BQ9Y620 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms