Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX10Q9Y5X0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms