Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms