Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF3AQ9Y496 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms