Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIT1Q9Y3P8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIT1Q9Y3P8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms